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英宗即位以后，中外奏章皆委内阁签办，事务的决定全力在内阁手上，有助于皇帝减压理政。
强化了明代的君主专制；废除宰相以后，六部分理庶务，大事由尚书主持的廷议决断。但是内阁制度形成以后，首辅依靠皇帝来指挥六部，六部的权利渐次遭到侵蚀。
由于内阁只能依附于皇帝，扩大内阁的权利，也是在扩大皇帝的权利。
政治其实就是循环，废相后，政治斗争持续在中外朝、皇帝与内阁、内阁与六部、皇帝与中朝等等之间交错其中。但是作为集权体制的核心，皇帝大多是处于掌控者的角色。
加上，内阁能否重用或者增减阁臣，取决于皇帝的个人意愿。
永乐时，阁臣是特简，虽然后期的廷推影响了皇帝的独裁，但是阁臣得不到皇帝的满意，仍旧会被打回。
张居正主政期间，几乎是独操太阿，死了之后，内阁的权利立即下滑，可见此制度间接加强了君主专制，君权无法节制。
大明的内阁还避免了独裁之臣出现的几率，这点上面，张居正是例外。
严格来说，张居正是个统筹者的角色，中朝和监护人皇太后履行着年幼的帝国君主的部分职权，所以内阁在此时权利很大。
皇帝成年以后，具有了单独决断庞大帝国行政事务时，就此一时彼一时了。
明代的内阁制度的缺点也很明显，助长了君主的专制内阁制度随君权的高度强化而建立，权力的来源，由君主所授予，对君权根本就无节制的作用，事无大小，内阁都要秉承皇帝的旨意行事，遂成为皇帝加强专制独裁的工具，使明代的君主专制比历代为甚，助长了君主专制。
形成了明代宦官的专权明代内阁因为欠缺法定的地位和权力，只是政务的补助机关，透过票拟、条旨来辅政，但大学士的票拟最后决定于皇帝的朱批，而明制以司礼监秉笔太监掌章奏文书。
宣宗时，大臣章奏除由皇帝亲批数本外，皆由秉笔太监照内阁大学士之票拟批红。
宣宗以后，人主怠荒，深居内宫，朱批便由秉笔太监处理，从此宦官透过司礼监的职务得以正式与外廷往来，宰辅之权便为内臣所侵夺，司礼监有太上内阁之称，造成了明代宦官的专横。
首辅有持相权而名不正的弊端内阁仅属秘书机关，无宰相之名，也无宰相之位，更无宰相之责，但皇帝信任时，又确有宰相之权利。
明代内阁成立后不久，事实的演变，产生首辅，权利堪比中国古代宰相。
但此不过内阁中相沿的惯例，并非律定，故不为外廷所承认。
《明史纪事本末》说：“严嵩无宰相之名，而有宰相之权；有宰相之权，而无宰相之责。”正是说出了内阁制度的弊端。
内阁有相权而无宰相之责，出错时便诿过他人，无宰相之名位而有宰相之权，则朝臣不能信服。
张居正任首辅，仍须与中官冯保结合才能执掌大权，方能施展抱负，就是很明显的例子。
明代宦官之祸严重，内阁制度之名不正，有着密切的关系。
逐渐演变成朋党的倾轧的摇篮内阁行使相权实在名不正言不顺，容易造成内阁与外廷官僚的磨擦。
所以，魏忠贤有事没事，遇到事情就爱推诿，推到内阁和出事的衙门之间，让内阁和衙门自己协商解决，根本不让事情捅到司礼监这一层面来，这才是最厉害的，会弄的出事衙门和内阁都没辙。
“魏公公，我们现在就写本子弹劾韦宝，陛下什么时候能批复？你们司礼监什么时候能批复、”杨涟问道：“不上朝，奏本总不能不批吧？”
“这咱家可不能给你准信！你的口气这么大，好像整个大明都是你在当家啊？那你就多催促内阁吧！”魏忠贤笑道。
“这事内阁如何管？朱大人只是次辅，没有顾秉谦的同意，能撤换韦宝吗？而且韦宝是陛下才刚刚御赐的官员，就是顾秉谦出面，也不见得行得通。”杨涟怒火攻心道。
“对，我现在就下令暂停韦宝对都察院和大理寺的考选！他没有经过任何人的同意，我们内阁更是听都没有听说过这桩事，谁同意他考选了？他更有什么权力随意提拔任命官员？更何况那郭文亮听说只有一个秀才的功名，一个秀才就想当堂堂都察院的御史，简直是荒唐！都察院御史，至少要在地方为官多年，做出成绩，深受百姓推崇，深受同僚，受朝廷认可，还得是进士出身，才能提拔，他郭文亮占到了哪一点？这不是胡闹吗？”朱延禧很少有的强硬道。
“可以，那是你的事情，你看着办吧。”魏忠贤笑道：“这不就好了吗？你们自己商量个主意出来，不就妥了吗？些许小事，非要闹到闯宫门不可？你们都当紫禁城是什么地方？”魏忠贤接着朱延禧和杨涟的话道。
只可惜朱延禧说的都是气话，他根本没有这么大的权力，别说他只是一个次辅，他就是首辅也没有罢免韦宝的权力！
明之内阁，上受君主的箱制，内受宦官的操纵，阁臣想握权，一方面须交结内监，另方面则又要倾轧同列的大学士，遂演成朋党之祸。
如严嵩任首辅，威权极崇，但却为阁僚徐阶所倾倒；张居正任首辅，也因内结司礼监冯保方能遂意，结成朋党，方可行使权力。
但在革弊振衰时，仍不免受言官攻击，被指责为揽权专断的权臣，甚至祸发身后，被夺爵抄家。
明代朋党倾轧激烈，实与内阁制度名实不符的矛盾看密切关系。
容易导致政风因循明代阁臣绝大多数由进士而入翰林，再而入内阁，多缺乏实际的政治经验，一旦入阁，多保守因循。
而且，内阁的权力，由皇帝授予，宦官又居中窃柄，阁臣为保官秩，于是只能对君主唯唯诺诺，对宦官俯首听命而不敢违，遂使政风因循腐化。
如张居正之循名责实，积极有为，仍非议四起，故后人多不敢有为，多随俗因循，政治更不堪闻问，对明代政治有极坏之影响。
弘治以后，阁臣在离阁前都能够获得殿阁大学士衔，所以后人将弘治至崇祯年间的所有阁臣都称为殿阁大学士或大学士。
但是不能反过来说殿阁大学士或大学士就是阁臣，洪武时期的殿阁大学士非阁臣，永乐以后殿阁大学士衔亦非阁臣所仅有。
殿阁大学士除了用于阁臣的加升外，还可用来褒奖忠孝或者加封、追赠有功之臣，具有多种用途。
在明代，确定阁臣身份的标准只有一条，即入直文渊阁参预机务，而非殿阁大学士的头衔。
在明代，入直文渊阁参预机务的除了殿阁大学士以外，还有修撰、侍读、侍讲、学士等。
韦宝现在就是皇帝的侍读学士，地位尊崇，哪里可能凭着朱延禧的一句气话就被罢免？
要想停下韦宝现在正在做的事情，得手里有人啊，可京城的兵权都在魏忠贤手里，东林党屡次吃亏，最主要还是毫无军事力量支持。
“魏公公，你不能这样坐视不管！若是如此，我们便明日一起上都察院去找韦宝！真的闹出人命来，这笔账要算在你魏公公头上！”杨涟怒道：“到时候可不要说我们擅杀朝廷命官。”
随着杨涟的大声鼓噪，现场的愤怒再次被点燃，官员们开始整齐的喊出了：“杀韦宝！杀韦宝！”
魏忠贤眼中寒意森森，知道这些人绝对不是喊着玩的，他们动不了自己，但是对付韦宝，其实并没有那么难。
“那是你们自己的事情，你们想怎么样就怎么样！”魏忠贤不耐烦道：“还有什么事情吗？没事的话，都速速退去！”
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